SJC by nemohlo fungovat bez podpory partnerů. Nejdůležitějším z nich je Magistrát města České Budějovice.
Na podzim roku 2008 oslovilo SJC VZP ČR, Krajskou pobočku pro Jihočeský kraj a Nemocnici České Budějovice a.s. s návrhem spolupráce. Obě organizace s návrhem souhlasily, výsledkem byl projekt Konference o celiakii, která se konala 25.4.2009.